工作台 / 序列比對
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SEQUENCE ANALYSIS / 01

Align. 序列比對

並排兩條序列，看見相同與不同。

01輸入序列

序列類型
純序列或 FASTA 格式
Reference0 bp
Query0 bp

每條上限 3,000 個字元；自動忽略空白並轉為大寫。

02比對設定

準備好兩條序列，就可以開始。

03比對結果

你的下一個發現，從這兩條序列開始。

貼上序列，或載入範例試試看。

從兩條序列開始

  1. 選擇 DNA、RNA 或 Protein，貼上純序列或各一筆 FASTA，也可以匯入檔案。
  2. Global 比較兩條完整序列；Local 找出其中得分最高的一對片段。
  3. 按下「開始比對」，查看相同率、gap、涵蓋率與逐字對照；可複製或下載帶 gap 的 FASTA。

如何解讀

相同率＝完全相同欄數 ÷ 對齊總欄數（包含 gap）。涵蓋率為參與比對的原始序列比例。分數會受長度和參數影響，不是機率，也不代表生物功能相同。

蛋白質採 BLOSUM62；DNA／RNA 模糊碼採字元比對，不展開可能鹼基。只比對輸入方向，不自動取反向互補。多個最佳解同分時只顯示其中一組。

第一版支援雙序列，每條上限 3,000 字元；不包含多序列比對或 3D 結構疊合。序列不會上傳或保存，重新整理後還原示範資料。

EMBL-EBI 比對概念 ↗評分與 gap 說明 ↗