工作台 / 序列比對
A little clarity for your next discovery.v1.0

SEQUENCE ANALYSIS / 01

Align. 序列比對

貼上自己的序列,沿著最佳比對路徑,看懂每一步。

01輸入序列

序列類型
純序列或 FASTA 格式

純序列或 FASTA 都可以,每條最多 3,000 個字元。完整比對並視覺化;兩條都在 80 字元內時,另可逐格查看 DP 矩陣。

02比對設定

準備好兩條序列,就可以開始。

03比對結果

你的下一個發現,從這兩條序列開始。

貼上序列,或載入範例試試看。

從兩條序列開始

  1. 選擇 DNA、RNA 或 Protein,貼上純序列或各一筆 FASTA,也可以匯入檔案。
  2. Global 比較兩條完整序列;Local 找出其中得分最高的一對片段。
  3. 按下「開始比對」,拖曳或播放最佳路徑,查看每一步的字母、座標、gap 扣分與累積分數;兩條都在 80 字元內時可展開 DP 分數矩陣。另有完整逐字對照;可複製或下載帶 gap 的 FASTA。

如何解讀

相同率=完全相同欄數 ÷ 對齊總欄數(包含 gap)。涵蓋率為參與比對的原始序列比例。分數會受長度和參數影響,不是機率,也不代表生物功能相同。

蛋白質採 BLOSUM62;DNA/RNA 模糊碼採字元比對,不展開可能鹼基。只比對輸入方向,不自動取反向互補。多個最佳解同分時只顯示其中一組。

第一版支援雙序列,每條上限 3,000 字元;不包含多序列比對或 3D 結構疊合。序列不會上傳或保存,重新整理後還原示範資料。